①彻底清塘消毒,加注不带隐藻的新鲜水:由于隐藻比其它藻类具有更强的竞争力,因此控制措施以预防为主、防重于治。彻底清塘消毒可有效杀灭隐藻、降低基数,可减少大规模发生的可能。同时应注意避免随加水带入隐藻,对控制隐藻也有积极意义。
②定期换鲜水:对于含有较多隐藻的池塘,经常大量地换新鲜水,可稀释隐藻的浓度。同时也稀释了隐藻分泌的毒物浓度,促进其它藻类的生长和保持整个生态系统的动态平衡。当隐藻大量发生时,可选用杀藻药物局部杀藻,三天后重新培养藻类。
③放养一定数量的滤食性鱼类:虽然隐藻不易被消化,但由于其颗粒较大,更容易被滤食性鱼类摄食到体内,在一定程度上延缓、阻碍了隐藻的生长。可供选择的鱼类有白鲢、花鲢、白鲫等。实践表明放养一定数量的滤食性鱼类时,基本不会爆发隐藻。